柔嫩艾美耳球虫主要侵害蛋鸡盲肠，会导致盲肠当中有凝血或者有出血块，会导致蛋鸡拉血便的状况，死亡率较高。

布氏艾美耳球虫寄生于小肠的后段，整个肠黏膜呈“干酪样病变斑”形成“伪膜”，肠黏膜增厚和水肿，可以引起严重的肠炎，死亡率较高。

毒害艾美耳球虫主要侵害小肠中段也可以引起严重肠炎，或者引起小肠充血，死亡率较高。

巨型艾美耳球虫，会造成小肠中段有淤血或者有紫色血斑点。

堆形艾美耳球虫主要侵害小肠的前段部分，一般在十二指肠，前段黏膜上有白色小点或是白带一样一些症状。